「聖妙」就是直接說出這尊佛的大慈、大悲、大願、大威神不可思議的大加持，是五濁惡世大混亂時代最關鍵的大威神正法，釋迦摩尼佛最後一道守護全人類的佛心正法就是藥師琉璃光佛。
佛陀在世，本來不說灌頂大法，怕以後祂的弟子不肖，利用灌頂大法賺錢，成佛將近20年教團弟子眾，有佛子被魔邪鬼怪擾亂，甚至被外道傷害祭法，乃至有的冤親債主絞纏，帝釋天子邀請佛陀講灌頂大法，因此佛陀不得不說。佛說灌頂大法之前，特別觀察：
世尊遙見無數比丘各各馳散，匆匆擾擾安，佛知故問，何故繞轉不樂，如魚畏網？比丘對曰：「我等為魔所嬈，在所不安......。」佛告比丘，勿生憂惱，當為汝說「灌頂章句，神王導護」，辟除邪惡，不令嬈害。
由此善妙因緣，世尊開演「佛說灌頂12系列」。
前十一系列是釋迦摩尼佛在遊化中所說灌頂法，金剛藏系列；第十二系列即藥師佛法門乃是佛陀遊化到廣嚴城，在樂音樹下休息，因文殊菩薩請法而說。文殊菩薩大智第一，洞澈了解明白末法時代有很多人修行，無緣無故就被擾亂，不知如何是好?希望佛陀介紹一切諸佛的本願功德，讓以後末法時代的佛子，可以聽到佛名的本願功德，能業障消除，結纏化解。
本師釋迦摩尼佛沒有講諸佛本願，直接講藥師琉璃光佛，因為藥師琉璃光佛的聖妙灌頂大加持法，可以說是十方諸佛最尊貴、最殊勝的法。藥師佛的灌頂大加持，第一大願就是，祂成佛後要建立法界灌頂大壇城，密授記一切眾生都可以跟祂一樣成佛。
眾生要如何才能與藥師琉璃光佛一樣成佛？大前提的圓滿法就是：轉變凡夫心，從佛心起修。
佛陀在世的時候 佛說的法一般都歸納在兩個重點：
第一個是淨土往生法門：易行道難成佛。
另一個是聖道法門：難行道易成佛。
在唐朝以前聖道法門很風行，聖道法一向都是靠自力，唐朝以後禪宗失色，真正大禪家沒有了，淨土宗興起，聖道法門式微。
聖道法最重要的就是明心見性，大死一番，把凡夫的習氣都轉掉，佛心提起、道心提起叫做大活現前。
藥師琉璃光佛法門，是聖妙灌頂大加持法，也是聖道法門第一大願的直接大光明法，正是直指凡夫心轉佛心，最妙大圓滿法，直接定位佛心起修。祂的第一大願，大願法脈肯定、認知、承擔。幫助我們在修法的時候，不被魔邪鬼怪干擾，不但不會干擾，魔邪鬼怪還會對我們敬重，因為幽冥界眾生、大靈界眾生都有佛心，當我們用佛心起修，大靈界眾生會被我們潛移默化，所以藥師經的第二大願說：幽冥眾生，悉蒙開曉，隨意所趣，作諸事業。世間要亂，無形界先亂，世間要安定，無形的大靈界、幽冥界安定，世間就安定！
藥師法門的殊勝稀有，是本師釋迦摩尼佛特別安排。在這個末法時代，不論修聖道菩薩法，不論修淨土往生門，都要依佛心大願行來修，當下我們自己這個心，就是佛心。
淨土往生法門於彌陀經中講，不可少善根福德因緣得生彼國。可惜現在一般佛教徒，以為只要唸阿彌陀佛就是大善根，其實真的大善根因緣是要不捨苦難眾生。念佛當然要緊，但是更重要的是念佛時，要肯定當下這念心是佛心念佛。不要忘記把佛的聖號念入我們的心，要了解佛心大慈、大悲、大願智要普護眾生。所以念佛要學佛的佛心大願智，不是只念佛而已，若光念佛，不以佛心願志為己心願智，光用凡夫心修淨土往生法門，在末法時代難得力。因為凡夫心念佛，魔邪鬼怪虎視眈眈，障礙我們成就。
所以們我們要學佛的願來行，我們的心跟古佛心同一體，好好修，速證菩提。聖道大圓滿法的灌頂大加持，修一法，成就一切光明法，妙破一切魔邪鬼神法。如果沒有這個法，釋迦摩尼佛最後一道佛心正法就不能圓滿。藥師法門是佛心慈愛，佛願真情意，純善大能量，純真大威神，貫穿過去、現在、未來的希望，希望大家肯定承擔人人菩薩化，大願付出在人間，為暗角的眾生做一回事，藥師佛聖妙灌頂大加持法必定相應護念到成佛。 末學 李文塗 敬十2013/1/4
